TATA BOX: MGA TAMPOK AT PAG-ANDAR - BIOLOGY - 2024

Ang kahon ng TATA , sa cell biology, ay isang pagkakasunud-sunod na pagkakasunud-sunod ng DNA na matatagpuan sa lahat ng mga linya ng mga buhay na organismo at malawak na inalagaan. Ang pagkakasunud-sunod ay 5′-TATAAA-3 ′ at maaaring sundan ng ilang paulit-ulit na adenines.

Ang lokasyon ng kahon ay pataas (o pataas, dahil madalas itong tinawag sa panitikan) mula sa pagsisimula ng transkripsyon. Matatagpuan ito sa rehiyon ng promoter ng mga gene, kung saan magaganap ang unyon na may mga salik na transkripsyon. Bilang karagdagan sa mga kadahilanang ito, ang RNA polymerase II ay madalas na nagbubuklod sa kahon ng TATA.

RNA polymerase II. Pinagmulan: Fvasconcellos 21:15, 14 Nobyembre 2007 (UTC)

Bagaman ang kahon ng TATA ay pangunahing pagkakasunud-sunod ng tagataguyod, mayroong mga gene na kulang ito.

katangian

Ang simula ng RNA synthesis ay nangangailangan ng RNA polymerase na magbigkis sa mga tiyak na pagkakasunud-sunod sa DNA, na tinatawag na mga promotor. Ang kahon ng TATA ay ang pagkakasunud-sunod na pagkakasunod-sunod ng isang tagataguyod. Ito ay tinatawag na kahon ng Pribnow sa prokaryotes, at ang kahon ng Goldberg-Hogness sa eukaryotes.

Kaya, ang kahon ng TATA ay isang konserbadong rehiyon sa DNA. Ang pagkakasunud-sunod ng maraming mga rehiyon ng pagsisimula ng pagsalin sa DNA ay nagpakita na ang pagkakasunud-sunod ng pinagkasunduan, o karaniwang pagkakasunud-sunod, ay (5ʾ) T * A * TAAT * (3ʾ). Ang mga posisyon na minarkahan ng isang asterisk ay may mataas na homology. Ang huling natitirang T ay palaging matatagpuan sa mga promo ng E. coli.

Ang lokasyon ng kahon ng TATA sa prokaryotes

Sa pamamagitan ng kombensyon, ang mga pares ng base na tumutugma sa simula ng synthesis ng isang molekula ng RNA ay bibigyan ng mga positibong numero, at ang mga pares ng base na nauna sa pagsisimula ng RNA ay binibigyan ng negatibong mga numero. Ang kahon ng TATA ay nasa -10 na rehiyon.

Sa E. coli, ang rehiyon ng promoter ay nasa pagitan ng mga posisyon -70 at +30. Sa rehiyon na ito mayroong isang pangalawang pagkakasunud-sunod ng pinagkasunduan (5ʾ) T * TG * ACA (3ʾ) sa posisyon -35. Gayundin, ang mga posisyon na minarkahan ng isang asterisk ay may mataas na homology.

Ang lokasyon ng kahon ng TATA sa mga eukaryotes

Sa mga eukaryotes, ang mga rehiyon ng promoter ay may mga elemento ng senyas na naiiba para sa bawat isa sa mga RNA polymerases. Sa E. coli isang solong RNA polymerase ang nagpapakilala sa mga elemento ng senyas sa rehiyon ng promoter.

Bilang karagdagan, sa eukaryotes ang mga rehiyon ng promoter ay mas laganap. Mayroong iba't ibang mga pagkakasunud-sunod, na matatagpuan sa -30 at -100 na rehiyon, na nagtatatag ng iba't ibang mga kumbinasyon sa iba't ibang mga promotor.

Sa mga eukaryotes, maraming mga salik sa transkripsyon na nakikipag-ugnay sa mga promotor. Halimbawa, ang kadahilanan TFIID nagbubuklod sa pagkakasunud-sunod TATA. Sa kabilang banda, ang mga ribosomal na RNA genes ay nakabalangkas sa anyo ng maraming mga gen, na sinusundan ng isa pa.

Ang mga pagkakaiba-iba sa mga pagkakasunud-sunod ng pinagkasunduan ng -10 at -35 na mga rehiyon ay nagbabago sa pagbubuklod ng RNA polymerase sa rehiyon ng promoter. Kaya, ang isang solong base ng mutation ay nagdudulot ng pagbawas sa rate ng pagbubuklod ng RNA polymerase sa rehiyon ng promoter.

Mga Tampok

Papel sa transkripsyon

Ang kahon ng TATA ay nakikilahok sa pagbubuklod at pagsisimula ng transkripsyon. Sa E. coli, ang RNA polymerase holoenzyme ay binubuo ng limang mga subunits na α ₂ ββσ. Ang unit subunit ay nagbubuklod sa dobleng stranded DNA at gumagalaw na naghahanap ng kahon ng TATA, na siyang senyas na nagpapahiwatig ng pagsisimula ng gene.

Paano nangyari ang transkripsyon?

Ang σ subunit ng RNA polymerase ay may napakataas na palagiang tagataguyod ng tagataguyod (sa pagkakasunud-sunod ng 10 ¹¹ ), na nagpapahiwatig ng isang mataas na pagkakakilanlan ng pagkilala sa pagitan nito at pagkakasunud-sunod ng kahon ng Pribnow.

Ang RNA polymerase ay nagbubuklod sa promoter at bumubuo ng isang saradong kumplikado. Pagkatapos ay bumubuo ito ng isang bukas na kumplikado na nailalarawan sa pamamagitan ng lokal na pagbubukas ng 10 mga pares ng base ng DNA double helix. Ang pagbubukas na ito ay pinadali dahil ang pagkakasunud-sunod ng kahon ng Pribnow ay mayaman sa AT.

Kapag ang DNA ay hindi malilimutan, nagsisimula ang unang mga form ng bono ng phosphodiester at pagpahaba ng RNA. Ang σ subunit ay pinakawalan at ang RNA polymerase ay umalis sa promoter. Ang iba pang mga molekula ng RNA polymerase ay maaaring magbigkis sa tagataguyod at magsisimula ng transkripsyon. Sa ganitong paraan ang isang gene ay maaaring mai-translate nang maraming beses.

Sa lebadura, ang RNA polymerase II ay binubuo ng 12 mga subunits. Ang enzyme na ito ay nagsisimula ng transkripsyon sa pamamagitan ng pagkilala sa dalawang uri ng mga pagkakasunud-sunod ng pinagkasunduan sa 5ʾ dulo ng pagsisimula ng transkripsiyon, lalo na: TATA consensus urutan; Nakasunod na pagkakasunud-sunod ng CAAT.

Mga salik sa transkripsyon

Ang RNA polymerase II ay nangangailangan ng mga protina, na tinatawag na TFII transkrip factor, upang mabuo ang isang aktibong transkripsyon na komplikado. Ang mga kadahilanan na ito ay pantay na natipid sa lahat ng mga eukaryotes.

Ang mga kadahilanan ng transkrip ay mga molekula ng isang likas na protina na maaaring magbigkis sa molekula ng DNA at may kakayahang madagdagan, bawasan o kanselahin ang paggawa ng isang tiyak na gene. Ang kaganapang ito ay mahalaga para sa regulasyon ng gene.

Ang pagbuo ng komplikasyong transkripsyon ay nagsisimula sa pagbubuklod ng protina ng TBP ("TATA-binding protein") sa kahon ng TATA. Kaugnay nito, ang protina na ito ay nagbubuklod sa TFIIB, na nakakagapos din sa DNA. Ang kumplikadong TBP-TFIIB ay nagbubuklod sa isa pang kumplikadong binubuo ng TFIIF at RNA polymerase II. Sa ganitong paraan, tinutulungan ng TFIIF ang RNA polymerase II na magbigkis sa promoter.

Sa huli, ang TFIIE at TFIIH ay magkasama at lumikha ng isang saradong kumplikado. Ang TFIIH ay isang helicase at nagtataguyod ng paghihiwalay ng double strand ng DNA, isang proseso na nangangailangan ng ATP. Nangyayari ito malapit sa site ng simula ng RNA synthesis. Sa ganitong paraan, nabuo ang open complex.

Mga kadahilanan ng transkripsyon at kanser

Ang protina ng p53 ay isang salik ng transkripsyon, na kilala rin bilang protina ng suppressor na p53. Ito ay produkto ng isang nangingibabaw oncogene. Ang Li-Fraumeni syndrome ay sanhi ng isang kopya ng mutated gene na ito, na humahantong sa mga carcinomas, leukemia, at mga bukol.

Ang P53 ay kilala upang mapigilan ang transkripsyon ng ilang mga gen at i-activate ang iba. Halimbawa, pinipigilan ng p53 ang transkripsyon ng mga genes na may tagataguyod ng TATA sa pamamagitan ng pagbuo ng isang kumplikadong binubuo ng p53, iba pang mga kadahilanan ng transkrip, at tagataguyod ng TATA. Sa gayon, pinipigilan ng p53 ang paglago ng cell.

Mga Sanggunian

1. Bohinski, R. 1991. Biochemistry. Addison-Wesley Iberoamericana, Wilmington, Delaware.
2. Lodish, H., Berk, A., Zipurski, SL, Matsudaria, P., Baltimore, D., Darnell, J. 2003. Cellular at Molecular Biology. Editoryal na Médica Panamericana, Buenos Aires.
3. Kaibigan, S. 1994. P53: isang sulyap sa papet sa likod ng paglalaro ng anino. Agham 265: 334.
4. Devlin, TM 2000. Biochemistry. Editoryal Reverté, Barcelona.
5. Voet, D., Voet, J. 2004. Biochemistry. Jonh Wiley at Anak, New York.
6. Nelson, DL, Cox, MM 2008. Lehninger - Mga Prinsipyo ng biochemistry. WH Freeman, New York.